1. Penjelasan Umum

Sebagai sekolah yang mengutamakan peningkatan kualitas siswa, SMAN 1 Tarakan telah mulai mengggunakan Kurikulum Tingkat Satuan Pendidikan ( KTSP ) sejak tahun pelajaran 2006/2007. Dengan menerapkan kurikulum ini diharapkan lulusan SMAN 1 Tarakan dapat menyesuaikan diri  dengan  perkembangan  ilmu  pengetahuan dan teknologi serta TIK yang berkembang pesat.

2. Program Studi

Terdapat 3 program studi pilihan yang dapat diikuti siswa SMAN 1 Tarakan sejak kelas XI berdasarkan minat, bakat dan kemampuan mereka , yaitu:

Program Studi Ilmu Alam, dengan mata pelajaran inti: Fisika, Kimia, Biologi, dan Matematika. Program ini  dapat dipilih oleh siswa yang memiliki minat, bakat dan kemampuan di bidang sains. Dalam program ini siswa mempelajari teori dasar dalam sains dan melakukan praktek sederhana di laboratorium. Di samping itu para siswa juga diajak untuk melakukan penelitian ilmiah di luar kelas dan membuat karya tulis ilmiah sebagai bagian dari tugas mereka. Bagi siswa yang memiliki bakat khusus, sekolah mengikutsertakan mereka dalam kegiatan ekstra kurikuler bidang sains yaitu Klub Biologi, Klub Kimia, Klub Matematika , Klub  Fisika dan Klub Astronomi. Anggota klub inilah yang disiapkan untuk mewakili sekolah dalam olimpiade sains. Lulusan dari program studi ini dapat melanjutkan  ke jenjang perguruan tinggi dalam bidang kedokteran, teknik, sains, dan sebagainya.

Program Studi Ilmu Sosial, dengan mata pelajaran inti: Ekonomi, Sosiologi, Sejarah, dan Geografi. Program studi ini dapat dipilih oleh siswa yang memiliki minat, bakat dan kemampuan di bidang ilmu sosial. Dalam program studi ini siswa mempelajari tentang teori dasar dalam Ilmu Ekonomi, Sosiologi, Geografi, serta Sejarah Nasional dan Sejarah Dunia. Siswa sering diminta untuk berdiskusi dan membuat laporan ilmiah tentang topik diskusi dan penelitian mereka, sehingga mereka memiliki kemampuan dalam menerapkan metode ilmiah untuk memecahkan masalah dalam kehidupan sehari-hari di sekitar mereka.

Program Studi Bahasa, dengan mata pelajaran inti: Bahasa dan Sastra Indonesia, Bahasa Inggris, Bahasa Jerman, dan Bahasa Jepang. Program ini dapat dipilih oleh siswa yang memiliki minat dan bakat di bidang bahasa dan budaya. Di sini para siswa mempelajari 4 kemampuan dalam setiap bahasa : menulis, membaca, mendengarkan, dan berbicara dalam Bahasa Indonesia, Bahasa Inggris, Bahasa Jerman, dan Bahasa Jepang. Di samping itu, mereka juga mempelajari tentang Sastra Indonesia dan Antropologi. Siswa yang berbakat dapat pula bergabung dalam ekstra kurikuler Klub Bahasa Inggris, yang menyiapkan siswa untuk dapat diikutsertakan dalam lomba Bahasa Inggris antar sekolah.

3. Pelajaran Umum

Seluruh siswa kelas X maupun kelas XI dan XII di semua program studi mempelajari pula pelajaran yang sifatnya umum, yaitu Pendidikan Agama, Pendidikan Kewarganegaraan, Seni Budaya, Olah Raga, Bahasa Asing, Kelautan, dan Komputer. Pendidikan Agama tersedia untuk Agama Islam, Kristen Protestan, Katolik, Hindu dan Budha,  baik teori maupun praktek. Pelajaran Seni Budaya dan Olah Raga lebih ditekankan pada aspek psikomotor atau  ketrampilan  geraknya. Untuk Bahasa Asing adalah Bahasa Inggris Pariwisata , penekanannya pada kemampuan berkomunikasi. Untuk pelajaran Komputer, siswa dilatih untuk dapat memanfaatkan semua  program  aplikasi  maupun  pengenalan pemrograman komputer. Dan Kelautan ditetapkan sebagai Muatan Lokal dalam KTSP sehubungan dengan letak geografis Tarakan.

 
4. Program Khusus Siswa Kelas XII

Terdapat dua program khusus yang secara rutin diprogramkan untuk siswa kelas XII setiap tahun. Pertama, adalah program jam tambahan untuk memantapkan persiapan menghadapi ujian. Kedua, pelaksanaan   TOEFL untuk mengukur kemampuan Bahasa Inggris siswa.

5. Jam Belajar

Siswa di SMAN 1 Tarakan belajar 45 jam pelajaran per minggu, dengan jadwal :
- Senin sampai Rabu:   pukul 7.15–16.00
- Kamis dan Sabtu:  pukul 7.15–13.00
- Jumat:                  pukul 7.15–11.15
Setiap Jumat pagi diadakan senam dan jalan santai bersama serta kegiatan  ekstra kurikuler  sebelum pelajaran di kelas yang dimulai pada pukul 9.45.

Selain itu, sekolah juga mengadakan sholat Zuhur berjamaah dan sholat Ashar berjamaah untuk program Full Day School yang dilakukan secara bergiliran.  Hal ini dilakukan untuk mewujudkan misi sekolah yang pertama, yaitu : Melaksanakan kegiatan peningkatan  iman  dan  taqwa untuk menumbuhkan kepribadian siswa sebagai insan yang berakhlak mulia.